公司转制成股份有限公司其分支机构同样是转制后的股份有限公司的分支机构吗？

是的。该主体只是企业类型发生了变更，但是该主体还是该主体，那么该主体的分支机构还是该主体的分支机构。对该主体的分支机构变更即可。