我在中山注册了一个新的医疗器械公司网站需要到哪个部门办理相关手续呢？

首先应该到当地药监部门办理注册网站的前置审批事项所需要提交的资料目录可以到国家药监网站上去查询，前置审批办好以后，再到当地通讯管理局办理注册登记，需要的资料要到当地通讯管理局去咨询一下，各个地区的可能不一样。

去信息产业部ICP/IP地址信息备案管理系统网站看说明，地址是：www.miibeian.gov.cn，会有详细的备案流程。