我想请问一下同一控制下的新设合并，有关股权的问题，是否需要转让呢？

以你们对A公司持有的股权作为对E公司的出资，即股权出资，在股权出资完成后，你们不再持有A公司的股权，而持有E公司的股权，E公司持有A公司的股权。不知道是否解决了你的问题，如有不明白的，欢迎继续探讨。