我公司借用他人公司去投标,中标后钱是打入那个公司账户中?

你说的是退保证金吧。一般情况下代理公司回退到你交纳保证金所用的账户里。你可以和代理公司协商。如果招标文件有要求说保证金须从公司基本账户进出，那就是退还到公司的基本户。

如果对方公司要求的比较的严格，那一定是要打入中标对应的公司的。

打入中标公司的总公司账户