主要区别如下：

1、个体工商户可以定期定额交税，有限公司不行；

2、个体工商户交的所得税是个人所得税（按五级累进税率交税，最高税额35%），有限公司 交的所得税是企业所得税（税率是25%）；

3、个体工商户净利润分到个人手上时无需再交个人所得税，有限公司净利润分到个人手上时要另交个人所得税（税率20%）。